1949年,新中国建立之初。江山初定,百废待兴,和平的表象下没有硝烟的战争早已拉开序幕。败逃台湾的国民党接连向大陆派出特工,伺机破坏。为了应对接二连三的破坏活动,中共成立情报部门701局与敌方展开连番较量。同年10月初,701局控制的侦听局莫名消失,为了查清消失电台的下落,701局负责人老鬼(王学兵 饰)授命代号二〇〇的张学宁(周迅 饰)去上海寻找耳力超群的钢琴调音师罗三耳。结果阴差阳错,学宁找到了罗德小徒弟——耳力同样超群的盲人调音师阿兵(梁朝伟 饰)。
阿李(刘青云 饰)是一位神父,一生兢兢业业传道授业,向世人宣讲神的伟大和光辉。然而,一场意外之中,阿李竟然沦为了强奸犯,被推上了被告人的席位,接受法律的审判。阿李的特殊身份令此案充满了猎奇的意味,人人都认为阿李必定获得有罪判决,然而只有阿李的心中明白,自己从未背叛过信仰 。